家庭教育指导师证书是由国家认可的教育或人力资源和社会保障部门权威颁发的，在中国，家庭教育指导师的认证主要由以下几个机构进行：

1、中国关心下一代工作委员会：这是一个全国性的非政府组织，专注于儿童和青少年的健康成长，他们提供家庭教育指导师的专业培训，并对合格者颁发证书。

2、教育部所属的教育培训机构：如中国教育学会、中国家庭教育学会等，这些机构会根据教育部的相关规定和标准，开展家庭教育指导师的培训与认证工作。

3、各地人力资源和社会保障局：他们会依据《职业教育法》和相关法规，授权或者直接进行家庭教育指导师的职业技能鉴定和证书发放。

4、部分高校和研究机构：一些高等学府的社会科学学院或者教育学院也会开设相关的课程和培训项目，完成学业并通过考核的学生可以获得相应的证书。

需要注意的是，每个机构的培训内容、考试要求和证书含金量可能有所不同，因此在选择培训和考取证书时，应充分了解各个机构的情况，以确保所获得的证书具备较高的专业性和社会认可度，持证人也需要定期参加继续教育，更新知识，提升能力，以保持证书的有效性。