心理咨询师证是由国家相关部门颁发的，而不是由中科院颁发，目前，中国的心理咨询师证书主要由国家卫生健康委员会（原国家卫生计生委）和人力资源社会保障部共同管理，这两个部门分别负责心理咨询师的培训、考核和认证工作。

我们来了解一下心理咨询师证书的发展历程，在2002年之前，中国的心理咨询师证书主要由国家卫生健康委员会颁发，随着心理咨询行业的发展，越来越多的人开始关注心理健康问题，对心理咨询师的需求也在不断增加，为了满足市场需求，提高心理咨询师的专业素质，国家卫生健康委员会与人力资源社会保障部于2002年联合发布了《关于加强心理咨询师职业资格认证工作的通知》，决定对心理咨询师的职业资格进行认证。

根据这一通知，心理咨询师的培训、考核和认证工作由国家卫生健康委员会和人力资源社会保障部共同负责，国家卫生健康委员会负责制定心理咨询师的培训大纲、教材和考核标准，组织和管理心理咨询师的培训工作；人力资源社会保障部则负责心理咨询师的认证工作，包括审核培训机构的资质、组织考核和颁发证书等。

自2002年以来，中国的心理咨询师证书制度得到了不断完善和发展，目前，心理咨询师证书分为两个等级：初级心理咨询师和中级心理咨询师，初级心理咨询师主要面向心理咨询行业的入门者，要求具备一定的心理学知识和实践能力；中级心理咨询师则主要面向有一定工作经验的心理咨询师，要求具备较高的专业素质和实践经验。

为了确保心理咨询师的专业素质，国家卫生健康委员会和人力资源社会保障部对心理咨询师的培训、考核和认证工作进行了严格的管理，培训机构需要具备一定的资质，才能开展心理咨询师的培训工作，心理咨询师的培训课程和教材需要符合国家卫生健康委员会和人力资源社会保障部的要求，以确保培训质量，心理咨询师的考核和认证工作也需要经过严格的审核，确保证书的权威性和可靠性。

虽然心理咨询师证书的颁发工作由国家卫生健康委员会和人力资源社会保障部共同负责，但在实际工作中，这两个部门并没有直接参与证书的颁发，相反，他们主要负责制定政策、管理和监督心理咨询师的培训、考核和认证工作，具体的证书颁发工作则由经过认证的培训机构和相关行业协会承担。

心理咨询师证书并不是由中科院颁发的，而是由国家卫生健康委员会和人力资源社会保障部共同管理，这两个部门负责制定心理咨询师的培训、考核和认证政策，确保心理咨询师的专业素质，他们还通过加强对培训机构和行业协会的监管，确保心理咨询师证书的权威性和可靠性。