国家级和地方级，国家级颁发机构包括中国国家人力资源和社会保障部、中国科学院心理研究所等，地方级颁发机构则包括各省、自治区、直辖市的人力资源和社会保障厅、卫生计生委等。
中国国家人力资源和社会保障部是国家级心理咨询师证书的颁发机构之一，该部门负责制定心理咨询师职业标准、培训大纲和考试大纲，并组织全国范围内的心理咨询师考试，考试合格者将获得由人力资源和社会保障部颁发的心理咨询师职业资格证书。
中国科学院心理研究所也是国家级心理咨询师证书的颁发机构之一，该研究所是中国心理学研究的重要基地之一，拥有丰富的心理学研究经验和师资力量，通过参加中国科学院心理研究所组织的心理咨询师培训课程并通过考试的学生，将获得由中国科学院心理研究所颁发的心理咨询师培训证书。
地方级的心理咨询师证书颁发机构则主要负责本地区内的心理咨询师培训和考试工作，这些机构通常由各省、自治区、直辖市的人力资源和社会保障厅或卫生计生委牵头成立，负责组织本地区的心理咨询师考试和证书颁发工作，北京市人力资源和社会保障局负责组织北京市内的心理咨询师考试和证书颁发工作；上海市卫生健康委员会则负责组织上海市内的心理咨询师考试和证书颁发工作。
除了国家级和地方级的心理咨询师证书外，还有一些国际性的心理咨询师证书，如美国心理学会(APA)认证的临床心理学家(CPC)证书、欧洲临床心理学协会(ECPa)认证的临床心理学家(EPC)证书等，这些国际性的心理咨询师证书在全球范围内具有较高的认可度和权威性，但需要参加相应的培训课程并通过考试才能获得。
